Obficie obsadzony przedstawiciel głównych ról negatywnych powraca, ale tym razem nie w formie zbioru humorystycznych "quickies", lecz w klasycznej zręcznościówce. Tym razem Wario wszedł w posiadanie magicznej różdżki, która pozwala mu na przybieranie najróżniejszych postaci w trakcie całej gry, dzięki czemu rozgrywka jest bardzo urozmaicona i oryginalna. Z tą cechą wiąże się również przemyślany projekt otoczenia gry - do pewnych miejsc (w których zazwyczaj znajdują się szczególnie cenne przedmioty i gadżety) można dostać się tylko w odpowiednim przebraniu. Do tego dochodzą sprawdzone minigry, intuicyjne sterowanie rysikiem i oczywiście nieodłączni bossowie strzegący końcówek każdego poziomu. Okradziony mag (będący pierwotnym właścicielem wspomnianej różdżki) nie zamierza jednak potulnie pogodzić się z zaistniałą sytuacją, dlatego też będzie nieustannie deptał Wario po piętach.