Syphon Filter: Logan's Shadow to kolejny tytuł ze znanej franczyzy stealth action, która ponownie "zaskakująco" skupia się na tajnym agencie Loganie, który wyrusza w pogoń za grupą ekstremistów, którzy wykradli nową, niebezpieczną technologię. W polowaniu na przestępców Logan zajrzy w głębiny Oceanu Indyjskiego, ale będzie też walczył na Bliskim Wschodzie. Najbardziej niepokojąca ze wszystkich będzie jednak możliwość, że jego wieloletnia partnerka, Lian Xing, jest podwójną agentką. Syphon Filter: Logan's Shadow zaoferuje taką samą rozgrywkę jak poprzedni tytuł. Będzie to zatem bardziej strzelanka z elementami stealth, oferująca szeroki wybór starych, znanych broni, ale także zupełnie nowych (granatnik, bomby dymne, granaty oślepiające, speargun i tak dalej). Poza sprawdzonymi komendami kontekstowymi (gra będzie proponować graczowi możliwe działania w zależności od sytuacji), Syphon Filter: Logan's Shadow będzie zawierał szereg nowych elementów, w tym walkę pod wodą, możliwość używania wrogów jako tarcz, możliwość osłaniania się poprzez strzelanie na oślep, nowe minigry, oryginalną historię autorstwa Grega Rucki, nową muzykę Azama Ali itd.