Bohaterem gry jest samotny kierowca ciężarówki, który w trakcie swojej zwykłej podróży zatrzymuje się w miasteczku Silent Hill, gdzie zmuszony jest stawić czoła nie tylko miejscowemu kultowi, ale także pułapkom własnego umysłu i niezbyt świetlanej przeszłości, aby wydostać się z Silent Hill i w końcu odkryć prawdę kryjącą się za halucynacjami, które dręczą go od tak dawna.
W porównaniu z oryginalną wersją, Origins oferuje nowe mechaniki rozgrywki zaprojektowane z myślą o handheldach PSP. Jedną z nich jest możliwość utrudniania postępów oszalałym mieszkańcom miasta poprzez budowanie barykad z mebli i wielu innych przedmiotów rozrzuconych strategicznie po lokacjach. Gra zawiera również zupełnie nową kamerę dostosowaną do panoramicznego ekranu PSP, a system sterowania jest również nowy. Gra zawiera również nieodłączną oryginalną ścieżkę dźwiękową autorstwa kompozytora Akiry Yamaoki, a w grze pojawia się kilka nowych postaci.