Pół wieku po tym, jak opór Czerwonej Frakcji i ich sojuszników uwolnił Marsa od brutalnych Ziemskich Sił Obronnych, harmonia na Marsie jest ponownie zagrożona, ale tym razem śmiercionośna siła jest owiana tajemnicą.
Kiedy masywny Terraformer, który zaopatruje Marsa w powietrze tak jak na Ziemi, zostaje zniszczony, atmosfera zamienia się w chaos, super tornada i błyskawice pochłaniają planetę. Aby przetrwać, koloniści muszą uciekać do podziemnych kopalni i budować sieć nadających się do zamieszkania jaskiń.
Pięć lat później Darius Mason, wnuk bohaterów marsjańskiej rewolucji Aleca Masona i Samanyi, prowadzi z Bastionu, na skrzyżowaniu metra, lukratywny biznes. Wydobycie, czyszczenie, praca jako najemnik w niektórych przypadkach, praca jest niebezpieczna, Darius jest twoim człowiekiem. Kilka rozsądnych osób, których biznes został zniszczony na powierzchni, staje się nabywcami od kontrahentów takich jak Darius i przemytników, którzy prowadzą interesy między osadami.
Kiedy Darius zostaje podstępem zmuszony do ponownego otwarcia tajemniczego szybu w starej świątyni Marauderów, długo uśpione zło zostaje uwolnione, wywołując Armagedon na Marsie. Jako kolonista znajdziesz rozdarte osady Marauderów. Możliwe, że tylko Darius i Czerwona Frakcja mogą uratować ludzkość. Bitwa będzie toczyć się na całej targanej burzami planecie, a także pod nią, w samym jej sercu.