Wszechstronne kontrolery Joy-Con oferują wiele opcji i ogromne wrażenia z gry. Kontroler Joy-Con może być używany samodzielnie w jednej ręce, osobno w obu rękach lub jako kontroler gry po podłączeniu do uchwytu Joy-Con.
Użyj ich do gry solo lub podziel się z przyjaciółmi i graj w trybie multiplayer. Każdy z kontrolerów Joy-Con ma własny zestaw przycisków i jest pełnoprawnym kontrolerem, a jednocześnie jest wyposażony w akcelerometr i żyroskopowy czujnik ruchu, co pozwala na niezależne sterowanie prawą i lewą stroną.
Lewy kontroler Joy-Con zawiera także przycisk Capture, dzięki któremu gracze mogą uchwycić najlepsze momenty w grze i podzielić się nimi ze znajomymi za pośrednictwem mediów społecznościowych. Prawy kontroler Joy-Con jest wyposażony w punkt NFC do interakcji z figurkami Amiibo.
Zawiera także kamerę ruchu IR, która może wykryć odległość, kształty i ruch pobliskich obiektów.
Może na przykład określić, gdzie znajduje się ręka gracza i jaki kształt tworzy. W kontrolerach Joy-Con wprowadzono także zaawansowaną funkcję HD Rumble, która pozwala graczom odczuwać realistyczne wibracje w kompatybilnych grach. Efekt ten jest bardzo szczegółowy i pozwala graczom odczuwać nawet tak delikatne wibracje jak drgania pojedynczych kostek lodu w szklance, które kontroler Joy-Con może symulować. Dzięki tej funkcji gracze poczują wyłącznie prawdziwe szczegóły, których nie da się osiągnąć za pomocą samego wzroku i słuchu.