Modern Warfare 3 rozpoczyna się od zakończenia drugiej gry z inwazją rosyjskiej armii na Manhattan (jak w Crysis 2), do której zostaje wezwana Delta Force. Wcielisz się w członka o imieniu Frost (jeden z dwóch debiutantów w serii), który lata nad Nowym Jorkiem w Blackhawku lub próbuje zatopić rosyjską łódź podwodną w rzece Hudson. Nie będziesz też narzekał na monotonię pozostałych czternastu misji w kampanii dla jednego gracza: będziesz przełączał się między rolami rosyjskiego agenta federalnego lub członka brytyjskiego SAS. Uzyskasz odpowiedzi na najbardziej nurtujące pytania, które tkwiły w twojej głowie od ostatnich epizodów.