Przeżyj nieopowiedzianą historię Jasona i Eve po tym, jak pokonali plagę mutantów na Ziemi, wyruszając w głąb kosmosu w swoim nowym czołgu bojowym "GAIA-SOPHIA"!
Historia Blaster Master Zero 2 rozpoczyna się kilka miesięcy po wydarzeniach z pierwszej gry, w której główny bohater Jason ratuje Ziemię przed mutantami. Eve została zainfekowana przez zmutowane komórki, które powoli niszczą jej ciało, więc wraz z Jasonem i Fredem wsiadają na pokład G-SOPHIA i rozpoczynają międzygalaktyczną podróż na rodzinną planetę Eve, Sophię, w nadziei na znalezienie lekarstwa na infekcję mutantów.
Idealne połączenie pełnej akcji kosmicznej przygody i charakterystycznej rozgrywki Blaster Master tworzy formułę nowego, zabawnego doświadczenia.
Szukaj wysoko i nisko na odwiedzanych planetach, aby znaleźć ukryte mapy małych planetoid na ich orbitach. Eksploruj różnorodne planetoidy, aby znaleźć ulepszenia dla G-Sophii i Jasona. Podczas swojej podróży Jason napotka pstrokatą załogę pilotów czołgów bojowych Metal Attacker i ich droidów wsparcia. Czasami są przyjaciółmi, a czasami wrogami.