Alliance: Future Combat to gra strategiczna czasu rzeczywistego z elementami taktycznymi, która oferuje graczowi możliwość wcielenia się w rolę dowódcy elitarnej amerykańskiej jednostki AEGIS lub objęcia przywództwa nad armią ekstremistów w ponad 20 różnych misjach. Akcja gry toczy się w 2008 roku, kiedy to obszar pomiędzy Iranem, Afganistanem, Indiami i Chinami został przekształcony w Demokratyczną Republikę Północnego Dżombistanu. Rząd nowego państwa potrzebuje każdego grosza, aby utrzymać je w ruchu, dlatego pozwala rządowi USA na budowę supertajnej podziemnej bazy wojskowej na terytorium Dżombystanu. Nikt jednak, nawet rząd Dżombystanu, nie wie, że baza wojskowa jest tak naprawdę ośrodkiem badawczym, w którym prowadzone są eksperymenty i badania nad inżynierią genetyczną i jej wykorzystaniem w działaniach wojennych.